Фамилия Никитын — редкий случай, когда на слух её легко спутать с массовой фамилией Никитин, но на письме разница принципиальна. Суффикс -ын, а не -ин, указывает на иную модель образования. В русской ономастике суффикс -ын (как в фамилиях Птицын, Лисицын, Голицын) обычно присоединялся к основам на -а, -я, но здесь мы видим основу «Никит-». Это не ошибка и не опечатка, а результат диалектного или исторического произношения. В северных и некоторых центральных говорах окончание -а в имени Никита могло редуцироваться, и фамилия образовывалась напрямую от усечённой основы: Никит + ын. То есть Никитын — это буквально «чей?» — сын Никиты.

Имя Никита пришло на Русь из греческого (νικητής — «победитель») и было очень популярно в крестьянской и купеческой среде. Фамилии на -ын вообще чаще встречались в северных и восточных регионах России, в зоне влияния новгородских и вятских говоров. Поэтому носители фамилии Никитын, скорее всего, имеют корни из этих областей. В отличие от фамилии Никитин, которая распространена повсеместно, Никитын — вариант более локальный и менее частотный.

Интересно, что в документах XVII–XVIII веков можно встретить оба написания одной и той же семьи: писарь мог записать «Никитин», а через страницу — «Никитын», в зависимости от местного произношения. Позже, при унификации фамилий, большинство выбрало стандартный вариант с -ин, но часть семей сохранила исходное диалектное написание. Так что Никитын — это не искажение, а живое свидетельство того, как по-разному звучала русская речь в разных уголках страны. Если ваша фамилия именно Никитын, это может указывать на давние корни в конкретном регионе, где такое произношение было нормой.