Фамилия Никитой — редкий и необычный случай в русской ономастике. Она не склоняется как типичная фамилия на -ов, -ев или -ин, а застыла в форме творительного падежа. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с грамматикой.

В основе фамилии лежит имя Никита. По одной из версий, фамилию могли дать человеку, который был, например, сыном Никиты, но не по отчеству, а по прозвищу, возникшему из бытового оборота: «чей ты будешь?» — «Никитой». То есть «тот, кого зовут Никитой» или «принадлежащий Никите». Такая модель образования встречается реже стандартной, но фиксируется в северных и сибирских говорах, где падежные формы имён могли закрепляться как фамильные прозвания.

Вторая, более прозаичная версия — фамилия могла возникнуть из-за ошибки в документах. При переписи населения или в церковных книгах писарь мог записать имя в творительном падеже («записан Никитой»), и эта форма закрепилась за родом. В пользу этого говорит то, что фамилия Никитой встречается крайне редко и не имеет массового распространения.

Имя Никита — греческого происхождения, означает «победитель». В русской традиции оно было популярно среди простых крестьян и купцов, реже — в дворянских родах. Соответственно, предки носителей фамилии Никитой, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми из северных или центральных губерний России, где падежные окончания в фамилиях иногда «застывали» по ошибке или по местной речевой традиции.

Однокоренные фамилии — Никитин, Никитский, Никитенко — образованы по стандартным моделям, тогда как Никитой стоит особняком. Если вы встретили эту фамилию, велика вероятность, что её носители происходят из одного небольшого рода, где форма закрепилась случайно или как местная особенность.