Фамилия Никитченков образована по редкой для русского языка модели: двойной суффикс «-енк-ов». Это сразу указывает на её украинские корни. В основе лежит просторечная форма имени Никита — Никитченко. На Украине и в Белоруссии фамилии на «-енко» (Никитченко) означали «сын Никиты» или «потомок Никиты». Когда носитель такой фамилии переселялся в великорусские губернии, его фамилию адаптировали под местную норму: к уже готовому украинскому «Никитченко» добавили русский патронимический суффикс «-ов». Получилось «сын того, кто сын Никиты».

Имя Никита пришло на Русь из греческого языка (nike — «победа»), поэтому Никита в переводе — «победитель». В крестьянской среде это имя было одним из самых распространённых, особенно после канонизации преподобного Никиты Столпника и Никиты-мученика. Фамилия Никитченков — не дворянская, а типично крестьянская или мещанская. Её носители — потомки тех, кто вышел с территории современной Украины или юга России (Курская, Воронежская, Харьковская губернии) и осел в центральных или восточных областях.

Интересная деталь: в отличие от фамилий Никитин или Никитов, где суффикс «-ин» и «-ов» присоединён прямо к основе имени, Никитченков сохранил в середине уменьшительный суффикс «-енк-», который в украинском языке придаёт имени оттенок почтительности или ласки. То есть Никитченко — это не просто «сын Никиты», а скорее «сын Никитки» или «маленький Никита». Фамилия встречается нечасто и практически не имеет вариантов написания: замена «е» на «ё» (Никитчёнков) ошибочна и встречается только из-за невнимательности писарей.