Фамилия Никлушова — женская форма, образованная от мужской Никлушов. Её основа и суффикс указывают на нестандартное происхождение, скорее всего, из прозвища, а не из крестильного имени напрямую.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов (в женском роде -ова) обычно присоединялся к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный. Здесь основа — Никлуш. Этот корень не встречается в списке распространённых русских имён, что заставляет искать объяснение в диалектной или прозвищной среде.

Наиболее вероятная версия: в основе фамилии лежит прозвище Никлуш. Оно могло возникнуть от глагола «никнуть» (опускаться, гнуться, падать духом) или от существительного «ник» (в некоторых говорах — низкое место, ложбина). Человек с таким прозвищем мог быть сутулым, робким или жить в низине. Суффикс -уш- в прозвище (Ник-уш) придаёт оттенок ласкательности или, наоборот, ироничного уменьшения, как в словах «дедушка» или «грязнушка». Таким образом, Никлуш — это «тот, кто никнет», «пригнутый» или «живущий в нику».

Менее правдоподобна версия о связи с именем Николай. В русском языке от Николая образуют фамилии через форму Никула (Никулин), Никольский или Никитин. Форма Никлуш (с «л») для Николая нехарактерна и не фиксируется в ономастических справочниках как стандартное производное. Если бы фамилия шла от крестильного имени, мы бы ожидали Никулов или Никульшин, а не Никлушов.

Географическая привязка у фамилии слабая, она редкая и не привязана к одному региону в массовых базах. Скорее всего, носители Никлушовых — потомки одного крестьянского рода, получившего прозвище в бытовой среде. Сословно фамилия типична для крестьян и мещан северных и центральных губерний России, где прозвища на -уш были особенно распространены.

Итог: фамилия Никлушова происходит от прозвища Никлуш, означавшего «никнущий», «согбенный» или «обитатель низины». Это не церковное имя, а бытовое прозвище, закрепившееся за родом.