Фамилия Нилепина — редкий случай, когда основа слова неочевидна и заставляет задуматься: что за «леп» и куда делась «с»? Скорее всего, перед нами не первоначальная форма, а изменённая в произношении или записи. Самый вероятный источник — глагол «слепить» или существительное «лепка», «лепнина». Фамилия могла возникнуть от прозвища Лепня или Лепила — так в старину называли мастера, работающего с глиной, строительным раствором или занимающегося лепным декором. Утрата начальной «с» в фамилии — явление для русской ономастики нередкое: в беглой речи «слепина» могла звучать как «лепина», а потом закрепиться на письме.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Нилепин — «сын Лепи» или «из семьи Лепиных». Женская форма Нилепина, соответственно, означает «дочь или жена Нилепина». В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Исходное прозвище Лепа (или Лепа) могло относиться к человеку с заметной внешностью — «лепый» в древнерусском означало «красивый, статный». Но для фамилии Нилепина такая версия слабее: прилагательное «лепый» редко становилось основой для прозвища в чистом виде, а вот ремесленная основа — лепка, лепить — даёт прямую и понятную мотивацию.

Есть и другой поворот: возможно, перед нами искажённое написание фамилии Нилепин от имени Нелепа или Нелепый. В говорах «нелепый» значило не только «некрасивый», но и «неуклюжий», «нескладный». Стечение согласных «сл» в начале слова иногда упрощалось, и «Нелепин» могло превратиться в «Нилепин» под влиянием акающего произношения. Однако эта версия менее вероятна, потому что фамилии с отрицанием «не-» в основе встречаются реже и обычно имеют более узнаваемый вид (Нелепов, Нелепин).

Географически фамилия Нилепина тяготеет к центральным и северным регионам России, где были распространены строительные и гончарные промыслы. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении: вероятно, предки носителя фамилии жили в одной деревне или небольшом уезде, где прозвище Лепа или Лепила закрепилось за целым родом.

Таким образом, Нилепина — фамилия, скорее всего, профессиональная, указывающая на предка-строителя, штукатура или гончара. Исходное прозвище звучало как Лепа, а форма с приставкой «ни-» — результат живого произношения и поздней фиксации в документах.