Фамилия Нишкунов является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Нишкунов образована от прозвища Нишкун. В его основе, скорее всего, лежит украинский глагол «нишкати», который в переводе означает «разузнавать, разыскивать». Вполне вероятно, что это прозвище отражало особенности характера и поведения предка (любопытство, хитрость, ловкость). Согласно другой гипотезе, прозвище ведет свое начало от русского слова «нишкнуть», то есть «не молвить ни словечка, молчать». В таком случае можно предположить, что основатель рода Нишкуновых был неразговорчивым человеком. Так и прозвище Нишкун закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Нишкунов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Нишкун, со временем получил фамилию Нишкунов. Безусловно, фамилия Нишкунов представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Нишкунов можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.