Фамилия Нистраков образована от просторечной формы крестильного имени Анастасий (от греческого «анастасис» — воскресение). В народной речи имя Анастасий, а также его женский вариант Анастасия, часто сокращали и переиначивали: Нистрат, Нистра, Нистраха. От этих обиходных форм через стандартный русский суффикс принадлежности -ов и возникла фамилия. Модель типична для XVII-XIX веков: сначала прозвище или уличное имя Нистрак, затем «Нистраков сын» и, наконец, закрепившаяся фамилия.

Суффикс -ак в основе Нистрак указывает на разговорный, даже простонародный оттенок. В русской антропонимии такие формы нередко давали человеку с грубоватым, простым нравом или использовались для сокращения длинного официального имени. Сравните: Нистрак — как Никита и Никанор превращались в Никак, или Агафон в Гапак. В отличие от фамилий на -ский, которые чаще носили дворяне и духовенство, Нистраков — типичная крестьянская или мещанская фамилия центральной России.

Географически Нистраковы встречаются в основном в Поволжье, особенно в Самарской и Саратовской губерниях, а также в Тамбовской области. Это косвенно подтверждает, что фамилия закрепилась в среде государственных крестьян и однодворцев. В документах XIX века Нистраковы фигурируют как хлебопашцы и мелкие торговцы, реже — как церковнослужители, хотя связь с церковным именем Анастасий прямая.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «нистрак» могло означать невысокого, коренастого человека или, напротив, непоседу. Но это вторичное, народно-этимологическое осмысление. Первичный источник — именно имя Анастасий. Фамилия редкая, не путайте её с Нистратовым или Анастраковым — это варианты той же основы, но с разными суффиксами и ударением.