Фамилия Низкошапко — одна из тех, что сразу выдают прозвище, а не имя в основе. Она образована по восточнославянской модели с суффиксом -ко, который в украинской и белорусской традиции превращал уличное прозвище в фамилию, часто без дополнительных прибавок. Это не «чей-то сын», а скорее «тот, кого прозвали Низкошапко».

Корень здесь составной: «низко» и «шапка». Прозвище могли дать человеку, который, по обычаю, снимал шапку низко, то есть кланялся, выказывая почтение — возможно, слишком усердно или, наоборот, подобострастно. В крестьянской среде, где шапку не снимали даже в избе, такой жест бросался в глаза. Однако есть и другая, менее очевидная версия: «низкошапко» могло быть ироничным прозвищем того, кто носил шапку низко, нахлобучив на лоб — либо по привычке, либо от холода, либо чтобы скрыть лицо. В любом случае, это не про происхождение от имени или профессии, а про внешнюю черту или манеру поведения.

Географически фамилия тяготеет к восточной Украине и югу России, где суффикс -ко встречается особенно часто. В XIX веке её носители, скорее всего, были крестьянами или казаками из Черниговской, Полтавской или Харьковской губерний. Сословная принадлежность здесь очевидна: прозвища такого типа редко давали дворянам или духовенству.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шапкин, Шапочкин, Шаповалов — показывает разницу в словообразовании. Низкошапко стоит особняком: в ней нет ни патронимического суффикса -ов, ни указания на ремесло (как у Шаповалов, то есть «делающий шапки»). Это чистое прозвище, застывшее в форме именительного падежа. По словарю Б. Унбегауна, такие фамилии характерны для украинской ономастики, где они не склоняются и часто указывают на конкретный, иногда случайный признак человека.

Встречаются редкие варианты написания — Низкошапка, Низкошапко (с ударением на последний слог). В дореволюционных записях фамилию могли искажать на «Низкошапков», пытаясь подогнать под русскую модель, но исходная форма устоялась именно с конечным -о.