Фамилия Нкитенко — редкий случай, где ошибка на письме закрепилась сильнее, чем исходный вариант. Вероятнее всего, перед нами искажённая запись фамилии Никитенко, которая, в свою очередь, образована от имени Никита. В русской ономастике суффикс -енко (украинской природы) указывает на «малого» или «потомка»: Никитенко — сын Никиты. Но почему исчезла буква «и»?

Тут возможны две версии, и обе связаны с канцелярской или устной небрежностью. Первая: при переписи или оформлении документов (особенно в XIX веке, когда фамилии массово фиксировали) писарь пропустил гласную, услышав фамилию как «Нкытенко» или просто сократив на слух. Вторая: в некоторых южнорусских и украинских говорах начальное «Ни-» в безударном положении редуцировалось почти до «Ны-», и на письме это отразилось как «Нк-». Так «Никита» могло превратиться в «Нкита», а затем в фамилию.

По сути, Нкитенко — это та же самая отчество-фамилия, что и Никитенко, но с дефектом записи. Подобные «потерянные» буквы встречаются у фамилий на -енко, например, Пташник вместо Пташников или Бондар вместо Бондаренко, но с пропажей целого слога — редкость. Если верить географическим данным, носители фамилии Нкитенко встречаются в основном в России и на востоке Украины, что подтверждает версию о случайном искажении при ручной записи: в регионах, где фамилию передавали по наследству уже в таком написании, ошибка стала нормой.

Разбирать корень «Нкит-» как самостоятельный смысла нет — он не имеет значения в славянских языках. Это калька с усечённого варианта имени Никита (греч. «победитель»). Таким образом, предок носителя фамилии Нкитенко был, скорее всего, сыном человека по имени Никита, а сама фамилия — живое свидетельство того, как писарская оплошность или диалектное произношение могут создать новую, пусть и редкую, ономастическую единицу.