Фамилия Ногаенко звучит как типичная украинская фамилия, и это верное первое впечатление. Её образует суффикс -енко, который в украинской ономастике означает «маленький», «сын» или «потомок» (как русские -ов/-ев или -ин). То есть Ногаенко — это «сын Ногая» или «потомок человека по прозвищу Ногай».

Ключ к фамилии — в основе «Ногай». Здесь возможны два разных корня, и оба ведут к прозвищам, а не к прямым именам. Первый и самый вероятный: Ногай — это тюркское племя, известное в истории как ногайцы (от имени хана Ногая, правителя Золотой Орды в XIII веке). На южных и восточных границах Руси ногайцев знали как кочевников-степняков, и прозвище «Ногай» могли дать человеку смуглому, черноволосому, либо тому, кто торговал или воевал с ногайцами. Второй вариант: «ногай» — диалектное или искажённое «нога» (в некоторых говорах «ногай» означало «длинноногий» или «быстроногий»). Но эта версия менее убедительна, так как фамилия Ногин или Ножкин встречается, а Ногаенко — именно с тюркским оттенком.

Географически фамилия Ногаенко сосредоточена на востоке Украины и в прилегающих областях России — в Харьковской, Сумской, Донецкой, а также в Ростовской области и Краснодарском крае. Это зона активных контактов славянских и тюркских народов, где прозвища по этническому признаку были обычным делом. Предок носителя фамилии мог быть казаком, крестьянином или мещанином, получившим прозвище за внешность или род занятий, связанных с ногайцами.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ко (Ногайко), которые встречаются в западных регионах Украины, Ногаенко — типичная для левобережья Днепра и Слобожанщины. Среди однокоренных фамилий — Ногаев (русский вариант через -ев), Ногайцев (с указанием на принадлежность к народу), а также Нога (более редкая). Фамилия не дворянская и не княжеская: в старых списках служилых людей она не фигурирует, что подтверждает её народное, прозвищное происхождение.