Фамилия Новкин образована от прозвища или нецерковного имени Новка. В основе лежит прилагательное «новый» — так могли назвать младенца, родившегося недавно, или нового члена общины, переселенца. Модель образования проста: к основе Новк- добавляется патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Новки). Такая схема типична для русских фамилий, особенно распространённых в северных и центральных губерниях, где суффикс -ин конкурировал с -ов.

Интересная деталь: фамилия Новкин могла возникнуть и от слова «новок» — так в некоторых говорах называли новичка, неопытного человека. В этом случае прозвище носило не возрастной, а социальный оттенок — его давали пришлому работнику или молодому подмастерью. Словарь русских фамилий Б. Унбегауна относит подобные образования к группе «характеристических» прозвищ, которые легко переходили в фамилии без изменения формы.

В отличие от более частых Новгородова или Новожилова, фамилия Новкин встречается реже. Географически она тяготеет к северо-западу России — в псковских и новгородских писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне с прозвищем Новко. Также возможна связь с топонимом Новая, Новки — такие деревни есть в нескольких областях, и житель одной из них мог получить прозвище по месту жительства. Но эта версия менее вероятна, так как фамилии от названий деревень обычно оформлялись суффиксом -ский (Новский), а не -ин.

Суффикс -к- в основе (Нов-к-а) придаёт прозвищу уменьшительно-ласкательный оттенок. В русской ономастике это типичный способ образования обиходных имён: Ивашка, Петрушка, Новка. То есть носитель фамилии Новкин — потомок человека, которого в своём кругу называли просто «новеньким», и это прозвище закрепилось за его родом. Фамилия недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская, без громких исторических фигур, но с ясной и прозрачной этимологией.