Новоенко – это фонетический вариант фамилии Навоенко, образованной от прозвища Навой. Прозвище Навой восходит к аналогичному нарицательному, которое означает «большая катушка для навивки нитей основы», «у ткацкого стана: задний вал, на который навита основа». Само слово «навой» происходит от глагола «навивать», то есть «наматывать, навертывать». Можно предположить, что основатель рода Новоенко был ткачом или работником текстильной фабрики. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Навой, со временем получил фамилию Новоенко.