Фамилия Ножкин напрямую связана с прозвищем Ножка. В труде С. Б. Веселовского «Ономастикон» упоминается Борис Васильевич Ножка, живший в Угличе во второй половине XV века. Именно от него, согласно записям, пошел род Ножкиных. Фамилия образована по стандартной притяжательной модели: сын, внук или более дальний потомок человека по прозвищу Ножка становился Ножкиным, то есть «тем, кто принадлежит роду Ножки».

Что могло означать само прозвище? В древнерусской традиции прозвища часто давались не в обиду, а для узнаваемости среди множества людей с одинаковыми крестильными именами. Ножкой могли называть человека с заметной особенностью походки, хромотой или просто того, кто был мал ростом и быстр, — ноги в переносном смысле были его главным инструментом. Также возможно, что прозвище относилось к человеку, который делал ножки для мебели или славился умением быстро ходить, выполняя поручения.

Важно не путать эту фамилию с профессиональной фамилией Ножовкин или Ножевкин, где основа — ремесленник, изготовитель ножей. Ножкин же происходит именно от уменьшительной формы слова «нога», а не от «ножа». Это редкий случай, когда суффикс -ин указывает на прямое родство с конкретным прозвищем, а не на занятие предка.

В документах XV–XVI веков фамилии на -ин чаще фиксировались в северных и центральных русских землях. Упоминание Углича — города с развитой торговлей и ремеслами — говорит о том, что род Ножкиных не был крестьянским. Борис Васильевич, судя по отчеству, принадлежал к служилому или посадскому сословию, где прозвища передавались по наследству и закреплялись в официальных бумагах.

Позже фамилия распространилась шире, но ее ядро осталось в Ярославской и соседних областях. Сегодня Ножкин — нечастая фамилия, и ее носители, скорее всего, действительно потомки того самого угличского рода, если их предки не получили фамилию при переписях по аналогии с уже существующей моделью. В любом случае, корень здесь один — прозвище, которое пять веков назад отличало конкретного человека от других Борисов.