Фамилия Нурекин — пример того, как географический маршрут и языковое смешение могут оставить след в русской ономастике. Вопреки интуитивному ожиданию, её основа не восходит напрямую к тюркскому слову «нур» (свет, луч), хотя такой вариант и возможен. Правдоподобнее версия, связывающая её с названием города Нурек в Таджикистане. Эта версия опирается на модель образования фамилий от топонимов с помощью суффикса -ин: житель Нурека — нурекинец, а его потомок — Нурекин. В пользу этого говорит и то, что Нурек — относительно молодой город (основан в 1960 году), а фамилия могла закрепиться за первыми поселенцами или строителями ГЭС, получившими прозвище по месту жительства.

Словообразовательная модель здесь проста: основа «Нурек» плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). В русской традиции этот суффикс типичен для фамилий, образованных от географических названий, оканчивающихся на согласный или -а/-я (сравните: Москвин, Тверитин, но здесь -ин заменил более редкий суффикс -ец). Если же отталкиваться от личного имени Нури (араб. «свет мой»), то фамилия должна была бы звучать как Нуриев или Нурикин, а не Нурекин. Поэтому топонимическая версия выглядит более состоятельной.

Спорным остаётся вопрос о возможной связи с фамилией Нуриев (через чередование и/е). Однако в случае Нурекин мы имеем дело с иным суффиксальным рядом: -ин вместо -ев, что принципиально меняет историю. Фамилия редкая, её носители, скорее всего, имеют корни в Средней Азии или Поволжье, где русское население смешивалось с тюркскими и иранскими народами. В дореволюционных переписях она не фиксируется, что подтверждает её позднее происхождение — не ранее середины XX века.

Таким образом, предок человека с фамилией Нурекин мог быть либо выходцем из города Нурек, либо его строителем, получившим прозвище по месту работы. Иных надёжных версий, уводящих в глубину веков, у этой фамилии нет.