Фамилия Ольгомец звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Скорее всего, перед нами пример фамилии, возникшей на стыке языковых и культурных традиций, где славянская основа получила «нерусскую» огласовку. Самая вероятная версия происхождения — от географического названия. В основе лежит топоним Ольгом (или Ольгома) — такое название носит река в Ленинградской области и Карелии, а также несколько небольших поселений. В таком случае житель этих мест получал прозвище «Ольгомец» — «тот, кто с Ольгома». Модель образования проста: корень «Ольгом-» плюс суффикс «-ец», указывающий на принадлежность к местности (сравните: Томск — томич, но по другой модели; ближе — Вологда — вологжанин, а вот жителя села Ольгомы назвали бы именно ольгомцем). Фамилия, таким образом, изначально была прозвищной, а затем закрепилась за потомками.

Менее убедительной выглядит версия о происхождении от личного имени Ольга. Суффикс «-омец» в русской антропонимии практически не встречается в качестве патронимического (указывающего на отца). Обычно от имени Ольга образуют фамилии Ольгин, Ольгов или, реже, Ольгович. Форма «Ольгомец» для отчества нехарактерна и выглядит искусственной. Поэтому связь с именем Ольга, хоть и напрашивается из-за созвучия, скорее всего, ошибочна.

Суффикс «-ец» в фамилии Ольгомец не только указывает на происхождение из конкретного места, но и может намекать на социальный статус предка. В центральной России фамилии на «-ец» нередко получали выходцы из крестьян, переселенцы, которые «приписывались» к новому месту жительства. Однако в случае с северными и карельскими топонимами (река Ольгома, Олонец) этот суффикс — обычный способ обозначить жителя, без дополнительного социального оттенка. География фамилии подтверждает эту версию: Ольгомцы встречаются преимущественно на северо-западе России, в Карелии и Архангельской области, что связывает её именно с теми местами.

В написании фамилии возможны варианты: Ольгомец (с ударением на первый или второй слог) и, реже, Ольгамец — если гласная «о» в корне под влиянием «акающего» произношения перешла в «а». Но исторически верной и наиболее частотной остаётся форма через «о». Носителям фамилии стоит обратить внимание на этот момент: при генеалогическом поиске в дореволюционных документах нужно проверять оба написания, так как писарь мог записать фамилию на слух.