Фамилия Омутко — редкий пример, где географическая привязка оказывается важнее, чем прозрачность корня. Сразу скажем: в центральных и северных русских говорах слово «омут» известно каждому — глубокое место в реке, водоворот. Однако фамилия Омутко почти не встречается в Вологодчине или на Волге. Основной ареал — западные и юго-западные регионы бывшей Российской империи: современные Украина, Беларусь, а также юг России. Это заставляет искать объяснение не в русском, а в местных диалектах.

Самый вероятный источник — украинское или белорусское прозвище «Омут», где слово могло означать не только речную яму, но и переносно — «тихий, но опасный человек», «скрытный», «тот, кто затягивает в дела». Суффикс -к- в фамилии Омутко — типичный для восточнославянских фамилий уменьшительно-ласкательный или патронимический, то есть «сын Омута» или «маленький Омут». Форма на -ко особенно характерна для Поднепровья и Левобережной Украины.

Менее правдоподобная, но существующая версия связывает фамилию с тюркским корнем «омут» — «надежда» или «ожидание». Однако для фамилии, бытующей в славянской среде, эта гипотеза слаба: нет ни письменных подтверждений, ни массовых следов тюркского влияния в данной модели фамилий. Если бы это было заимствование, мы бы видели варианты вроде «Омутов» или «Умутов» в татарских родах, но их нет.

Таким образом, предок носителя фамилии Омутко — скорее всего, человек из украинского или белорусского села, получивший прозвище по характеру или поведению. Он мог быть рыбаком, знавшим опасные омуты, или же неразговорчивым, себе на уме соседом. Фамилия не дворянская, не купеческая — крестьянская или казачья, что подтверждается её отсутствием в родословных книгах и сосредоточением в реестрах сельских приходов XIX века.