Фамилия Омутных — редкий пример родового именования, которое застыло в форме родительного падежа множественного числа. Суффикс -ых (а в старом написании -их) указывает на севернорусское или сибирское происхождение: так оформляли фамилии в Вологодской, Архангельской, Вятской губерниях, а позже — у уральских и сибирских крестьян. В отличие от центральной России, где преобладали фамилии на -ов/-ев, здесь человека могли записать как «Омутных» — то есть из семьи Омутных, где главу прозвали Омут.

В основе прозвища — слово «омут»: глубокое место в реке, водоворот, яма с водой. Прозвище Омут могли дать человеку с тёмным, неспокойным нравом, скрытному или угрюмому. Но возможна и более приземлённая версия: так могли назвать рыбака, который знал все омуты на реке, или мельника, чья мельница стояла у глубокого места. В северных говорах «омутистый» означало «с большими омутами», так что прозвище могло относиться к месту жительства — например, к деревне у речного омута.

Интересно, что в документах XVI–XVII веков встречается фамилия Омутов — она образована по той же основе, но с другим суффиксом. Омутных — это вариант, закрепившийся в тех регионах, где было принято отвечать на вопрос «чьи вы?» формой множественного числа. Такие фамилии не склоняются по падежам и не меняются по родам, что сразу выдаёт их северное происхождение.

Споров вокруг корня почти нет: все версии сходятся к «омуту». Единственное, что может сбить с толку, — это редкая огласовка «Омутных» вместо более привычного «Омутовых». Но именно эта форма и есть исторически точная для определённой территории: она не «испорченный» вариант, а архаичная модель, сохранившаяся в народной среде.