Фамилия Онушков — редкий случай, где основа прозрачна, а суффикс заставляет задуматься. В ней отчётливо слышится диалектное «ону́шка» — так в южных и западных говорах называли лапоть, а точнее, онучу, то есть портянку, обмотку для ноги. Казалось бы, прозвище Онýшко или Онýшка могли дать человеку, который носил плохую, рваную обувь, либо тому, кто плёл лапти или торговал онучами. Но здесь интереснее морфология: суффикс -ов- указывает на патронимическую модель («чей?» — Онушков), однако основа обрывается не на -а, а на -к. Это значит, что прозвище звучало как Онушко (с ударением на первый слог, как в украинской или белорусской традиции) или как Онушка (в русском варианте). В первом случае фамилия — типично украинская или южнорусская: Онушко → Онушков. Во втором — более редкая, с отсечением конечного -а.

Есть и вторая, менее бытовая версия: от канонического имени Онисим (разговорные формы Ону́шка, Ону́ха). Через уменьшительное Онушко могли называть человека, который в быту звался Онушей. Тогда фамилия встаёт в один ряд с Онучиным, Онуфриевым, но с другим суффиксом. Однако против этой версии говорит то, что от Онисима чаще образовывались Онучин, Онисимов, а Онушков — единичный случай. Правдоподобнее связь с онучей: прозвища по предметам одежды и обуви в крестьянской среде были обычным делом, и фамилии вроде Лаптев, Онучин, Чулочников встречаются повсеместно.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине. В дореволюционных переписях Онушковы фиксировались в Курской, Воронежской губерниях, а также среди казачества. Носители её почти наверняка были из крестьян или однодворцев — людей, которые жили земледелием и ходили в лаптях. Суффикс -ов, а не -ин, тоже говорит о том, что основа была на твёрдый согласный (Онушко), а не на -а (Онушка), что типично для украинского ономастикона.

Таким образом, Онушков — фамилия, которая прямо указывает на быт и ремесло предка: либо он носил онучи, либо их делал. Это не дворянская и не духовная фамилия, а народная, крестьянская, с южным акцентом.