Фамилия Паис, скорее всего, происходит от эстонского слова pais, которое в переводе на русский язык означает «плотина». Вполне вероятно, что основатель рода Паис был хозяйственным и практичным человеком, за что и получил фамилию Паис сначала в качестве личного прозвища. Возможно также, что фамилия Паис образована от другого эстонского слова — paise со значением «нарыв, язва». В таком случае Паисом могли называть того, кто страдал этим недугом. Однако такое прозвище мог носить и здоровый человек в качестве оберега, предохраняющего от болезней. Кроме того, существует гипотеза, что фамилия Паис имеет литовские корни и связана с глаголом paisyti - «смотреть, обращать внимание». Соответственно, Паисом могли прозвать внимательного и любознательного человека. Наконец, нельзя исключать и возможность образования фамилии Паис от испанского слова paisano, которое имеет два значения: «земляк, односельчанин» и «крестьянин, деревенский житель».