Фамилия Пакис — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а греческое или балканское. В русском языке у фамилии нет привычного суффикса (-ов, -ин, -ский), который указывал бы на типичную модель образования от отчества или прозвища. Окончание -ис характерно для греческих фамилий, особенно тех, что попали в Россию через переселенцев из Понта, Малой Азии или с Ионических островов.

Скорее всего, основа Пакис восходит к греческому слову «πάκης» (пакис) — «плотный», «крепкий», «сбитый». В переносном смысле так могли прозвать коренастого, физически сильного человека. В греческой ономастике фамилии на -ис часто образованы от прилагательных или личных качеств: Пакис — «крепкий», как, например, Каллис — «красивый» или Макрис — «длинный». Есть и другая, менее вероятная версия: связь с турецким «pak» (чистый, непорочный), но в греческом контексте «плотный» выглядит убедительнее.

В России фамилия Пакис встречается крайне редко. Её носители — это почти наверняка потомки греческих переселенцев, которые в XVIII–XIX веках оседали в Новороссии (Одесса, Мариуполь, Таганрог), на Кубани или в Крыму. Часть греков бежала в Российскую империю от османского гнёта, и фамилии вроде Пакис — немые свидетели этой миграции. В советское время фамилия могла закрепиться и в других регионах, но её географический центр — юг России и Причерноморье.

Интересно, что фамилия Пакис не даёт сословной привязки. Греческие переселенцы были разными: среди них встречались и купцы, и ремесленники, и крестьяне. Поэтому предки носителя фамилии могли быть и рыбаками на побережье, и торговцами в портовом городе. Единственное, что объединяет большинство Пакисов, — это память о греческих корнях, пусть и отдалённая.