Фамилия Пакарскас сразу выдаёт литовское происхождение: окончание -ас — один из главных маркеров мужских фамилий в Литве. В русской среде такие фамилии часто не склоняются или получают русифицированные варианты, но исходная форма указывает на балтские корни носителя.

Основа фамилии — Pakar- — скорее всего, восходит к литовскому слову pakaras, что значит «подвес» или «подвешенное». Однако более вероятно, что перед нами топонимическая фамилия: в Литве существует несколько мест с названием Pakarčiai (Пакарчяй) или Pakarčiai, а также деревня Pakarčiai в Шяуляйском уезде. Суффикс -sk- в литовских фамилиях (сравните: Pakarskas) часто указывает на принадлежность к месту или на происхождение оттуда. Таким образом, Пакарскас — это «тот, кто из Пакарчяй» или «пакарчский».

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с профессией: pakartojas по-литовски — «вешатель», то есть палач. В таком случае прозвище могло закрепиться за человеком, выполнявшим эту мрачную работу, или за его потомками. Однако в литовской ономастике профессиональные фамилии с таким суффиксом встречаются реже, чем топонимические, поэтому версия с названием поселения выглядит правдоподобнее.

Фамилия Пакарскас не входит в число самых распространённых в Литве, но встречается в центральных и северных регионах страны, особенно в окрестностях Шяуляя и Паневежиса. В России и Беларуси её носители — потомки литовцев, переселившихся в XIX–XX веках, либо люди, чьи предки получили фамилию при русификации литовских имён.

С точки зрения словообразования, Пакарскас — типичная балтская фамилия на -skas, аналогичная славянским фамилиям на -ский, но с литовским окончанием. Она не имеет прямых аналогов в русском языке, но может быть родственна польским фамилиям типа Pakarski, которые иногда возникали на землях бывшего Великого княжества Литовского.