Фамилия Пакидовы на первый взгляд кажется простой, но за ней скрывается сразу несколько версий происхождения, и ни одна из них не является бесспорной. Наиболее вероятная и логичная связывает её с древнерусским мирским именем Покид. Если принять эту версию, то Пакидов — это фонетический вариант фамилии Покидов, где гласный «о» под влиянием аканья (произношения, при котором безударный «о» звучит как «а») перешёл в «а»: Покид — Пакид. Такое изменение — не редкость для русских фамилий, которые часто фиксировались на слух.

Имя Покид, в свою очередь, образовано от глагола «покидать». В Древней Руси подобные имена-обереги были в ходу: называя ребёнка Покидом, родители выражали надежду, что он не будет «покинутым», то есть не останется сиротой и не будет оставлен родом. Прямое подтверждение тому, что имя существовало, находим в письменных источниках конца XVI века: в Рязани упоминается Покид Дмитриевич Кученев. Это реальное историческое свидетельство, которое делает версию о происхождении от имени Покид самой убедительной.

Вторая версия, менее вероятная, но всё же имеющая право на существование, выводит фамилию напрямую от прозвища Пакид, минуя промежуточную форму Покидов. Сторонники этой гипотезы обращаются к ивриту, где слово «пакид» означает «чиновник» или «прибыль». Если следовать этой логике, прозвище могло указывать на род занятий основателя рода — человека при должности, чине, либо на его предприимчивость и богатство. Однако эта версия выглядит натянутой: для русского ономастикона заимствование из иврита в качестве прозвища — случай редкий и не подкреплённый контекстом. Скорее всего, здесь мы имеем дело со случайным звуковым совпадением.

Таким образом, потомки человека по имени Покид, пройдя через стадию фамилии Покидов, со временем стали писаться как Пакидовы. Сама фамилия — живой памятник славянской письменности, который сохранил и древнее имя-оберег, и особенности народного произношения, изменившего её звучание.