Фамилия Панаргины — редкий пример, где основа, скорее всего, связана не с профессией или личным именем, а с прозвищем, построенным на греческом корне. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Панаргин — «сын Панарги» или «человек из рода Панарги». Само прозвище Панарга могло возникнуть от греческого слова «панаргия» (πανάργεια) — «всевластие», «полновластие». В таком случае прозвище давали человеку властному, самостоятельному, привыкшему всё решать самому. Вероятно, это была характеристика характера, а не должности.

Менее распространённая, но возможная версия отсылает к церковной лексике. В греческой традиции «панагия» — это Богоматерь, Всесвятая, а также нагрудная икона, которую носили архиереи. Однако форма «Панаргин» с буквой «р» в середине делает эту связь менее прямой, хотя исключать диалектное искажение или переосмысление не стоит: в народе сложное слово могли «подогнать» под более привычное звучание.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где было сильно влияние греческой культуры через торговлю и церковные связи. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: прозвище могло закрепиться за одним родом в конкретной местности и не получить массового распространения. В документах XVIII–XIX веков Панаргины могли быть как духовного, так и купеческого сословия — в среде, где грамотность и знание греческого имели значение.

Интересное отличие Панаргиных от похожих фамилий — отсутствие однозначного «ремесленного» следа. Если Панарины или Панаевы часто выводят от профессий или личных имён, то здесь на первый план выходит именно прозвище-характеристика, что делает фамилию скорее психологической, чем социальной.