Фамилия Панифодов — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается нерусское, а точнее — греческое, имя. Основа здесь — каноническое крестильное имя Панифид, или Панифод, которое в православных святцах встречается в форме Панифид. Это имя греческого происхождения, от panephodos, что можно перевести как «всегда идущий» или «повсюду следующий». В бытовой русской традиции такие длинные греческие имена нередко усекали или переделывали на свой лад, но Панифод сохранился почти без изменений.

Суффикс -ов указывает на стандартную патронимическую модель: Панифодов — сын Панифода. Принадлежность к этой модели говорит о том, что фамилия складывалась в центральной и северной частях России, где -ов было основным способом образования фамилий, в отличие от украинского -енко или белорусского -ич. Встречаются также варианты написания с одной «ф» — Панифодов, что объясняется простонародным произношением, где греческое «ph» часто упрощалось до «ф».

Имя Панифид — редкое. В святцах оно связано с мучеником Панифидом, пострадавшим в III веке. На Руси такие имена давали в основном в монашеской или священнической среде, но изредка и мирянам, особенно в семьях, где чтили память малоизвестных святых. Поэтому предки Панифодовых могли быть либо выходцами из духовного сословия, либо крестьянами, получившими имя по святцам от набожных родителей.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям — Воронежской, Тамбовской, Рязанской. В этих краях имя Панифид, хоть и редко, но фиксировалось в переписных книгах XVII–XVIII веков. После реформы 1861 года, когда фамилии стали массово закрепляться, Панифодовы могли расселиться и дальше, но исходный ареал остался в черноземной полосе.

Что интересно: фамилия Панифодов легко путается с Панифатовым или Панифидовым, но это разные основы. Панифатов, например, восходит к имени Панифат (от греческого «всенесущий»), а Панифидов — к более редкому варианту Панифид. Так что Панифодов — не опечатка и не искажение, а самостоятельная ветвь, сохранившая греческий корень в почти нетронутом виде.