Фамилия Панютчев — это не самостоятельное прозвище, а результат естественного сокращения более длинной фамилии Панютичев. Такое «усечение» — частая история в русской ономастике: длинные отчества второго порядка со временем упрощались в бытовой речи, теряя один слог, и это упрощение закреплялось в документах.

Чтобы понять корень, разберем цепочку. Исходная фамилия Панютичев образована от именования Панютич. Компонент «-ич» — древний славянский суффикс отчества, который указывал на прямого потомка. То есть Панютич — это сын Панюты. А сама фамилия Панютичев — отчество второго порядка: сын Панютича, внук Панюты. Подобная модель (имя → отчество на «-ич» → фамилия на «-ичев») встречается у многих русских родов, но не всегда сохраняется в первозданном виде.

Имя Панюта, которое лежит в основе, — это народная, уменьшительно-ласкательная форма сразу нескольких крестильных имен. Самая вероятная версия — от имени Павел, что в переводе с латинского означает «маленький». Это объясняется просто: имя было чрезвычайно распространено, а Панюта — естественное просторечное сокращение, подобно тому как Паша или Павля превращались в самостоятельные прозвища. Реже исследователи допускают, что Панюта могла быть производной от Пантелеймона (греческое «всемилостивый»), Панкрата («всемогущий») или Панфила («всеми любимый»). Однако версия с Павлом выглядит предпочтительнее хотя бы потому, что имена на «Пан-» в народной среде чаще всего сводились именно к самому ходовому из них.

Интересна и география. Фамилии с суффиксом «-ичев» и последующим упрощением до «-чев» тяготеют к южнорусским и украинским говорам, где аканье и редукция гласных сильнее влияли на письменную фиксацию. Впрочем, точных данных о сословной принадлежности первых Панютчевых нет — это могла быть и крестьянская семья, и мещанская, поскольку именование по деду-Панюте не несло социальной окраски.

Таким образом, современный носитель фамилии Панютчев — это потомок человека, которого в третьем поколении называли по деду: от Панюты к Панютичу, от Панютича к Панютичеву, а затем — к более короткому Панютчеву.