Фамилия Панженский — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, стоит сразу отбросить суффикс -ский, который в русских фамилиях чаще всего указывает на географическую основу: Панженский — тот, кто родом из места с названием Панжено, Панжово или Панж. Но вот географическая привязка слабая: ни одного населённого пункта с таким корнем в современных атласах нет. Возможно, топоним был утрачен или существовал в виде небольшого хутора, который не сохранился в документах.

Другая, более правдоподобная версия — искусственное происхождение. Фамилии на -ский в XIX веке часто давали семинаристам при поступлении в духовные училища. Им меняли бытовые фамилии на благозвучные, книжные, часто от названий церковных праздников, икон или от греческих и латинских слов. Корень «панж» может быть искажением от греческого «пан» (всё) или от латинского «pango» (вбивать, сочинять). Но это гадательно.

Самое вероятное объяснение лежит в основе прозвища. В южнорусских и украинских говорах «панжа» или «паньжа» — пренебрежительное название пана, мелкого помещика или человека, который важничает, «панькается». Суффикс -енск- в таком случае образовывал фамилию по модели «чей?»: Панженский — сын Панжи, потомок того, кого дразнили Панжей. В пользу этой гипотезы говорит и то, что фамилия встречается в основном на западе России и в Беларуси, где слово «пан» было бытовым и могло обрасти производными.

Сословная принадлежность Панженских, скорее всего, крестьянская или мещанская. Дворянские роды с такой фамилией в «Бархатной книге» и других родословных сборниках не значатся. Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия не массовая, её носители — потомки либо выходцев из небольшой местности с несохранившимся названием, либо людей, получивших прозвище за показное поведение.