Фамилия Папий образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Папий послужило церковное имя Папий. Папий — каноническое мужское имя, которое восходит к греческому pappias и переводится на русский язык как «папочка». Покровителем этого имени считается Папий Иерапольский или Гиерапольский, раннехристианский святой, писатель, один из апостольских мужей. Он является автором не дошедшего до нас пятитомного труда «Изложение изречений Господних». Сочинение Папия сохранилось в виде фрагментов и цитат в произведениях других авторов. Источником книги Папия были рассказы «старцев», очевидцев земной жизни Иисуса Христа. По словам Папия, некоторые из приведённых им рассказов он слышал от живших в Иераполе дочерей апостола Филиппа.Сообщения Папия проливают бесценный свет на ранние годы существования христианства; в числе прочего он упоминает Евангелие от Матфея на иврите. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Папий, со временем получил фамилию Папий. О точном месте и времени возникновения фамилии Папий в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Папий представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.