Фамилия Папукчи — редкая, с ярко выраженным ремесленным корнем. Её происхождение напрямую связано с тюркским языком, точнее, с турецким или крымскотатарским словом «papukçu» (или «papuççu»), которое означает «сапожник», «башмачник» или «изготовитель домашних туфель». Основа «papuk» (папук, папуч) — это мягкая туфля без задника, распространённая на Востоке. Суффикс «-чи» (-çı) в тюркских языках образует названия профессий: как «кебабчи» — тот, кто готовит кебаб, так и «папукчи» — тот, кто шьёт папуки.

Словообразовательная модель фамилии нетипична для русского языка, где преобладают суффиксы -ов/-ев, -ин. Папукчи — это так называемая «архаичная» или «сырая» фамилия, то есть она не получила русского патронимического окончания и вошла в обиход в первоначальной тюркской форме. Такое часто случалось с фамилиями выходцев из Османской империи, Крыма, Закавказья или народов Северного Кавказа, которые оказывались в русской среде. Фамилия могла закрепиться за ремесленником, переехавшим в южнорусские или украинские города, где были развиты сапожные цеха.

Географически фамилия Папукчи встречается крайне редко, в основном у потомков греков, армян или крымских татар, переселившихся в Приазовье и Кубань (так называемые «греки-урумы» иногда носили подобные фамилии). Встречается она и у турок-месхетинцев, осевших в Средней Азии и на юге России. В современной России носителей фамилии можно найти в Краснодарском крае, Ростовской области и в Москве — как следствие миграций XX века.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно вспомнить Папуков (уже русифицированная форма) или Папук (чистая основа без суффикса профессии). Папукчи стоит особняком: она не утратила профессионального указателя и потому сразу сообщает, что предок был не просто человеком по имени Папук, а конкретно мастером-обувщиком. Никакой дворянской или разночинной истории за ней не стоит — это чисто ремесленная, «цеховая» фамилия, которая попала в русский быт благодаря южным торговым связям.