Фамилия Парафесь — редкий пример, где основа и суффикс разбираются почти с ходу, а вот корень ставит в тупик. С точки зрения словообразования это типичная украинская или белорусская фамилия с суффиксом -есь. Такая модель характерна для западнорусских земель: суффикс -есь прикрепляли к личным именам или прозвищам, образуя фамилии вроде Бондаресь, Ковалесь. В русском языке аналогом выступает суффикс -ов/-ев, но на юго-западе предпочитали другие окончания.

Основа Параф- — самое интересное. Скорее всего, это искажённое каноническое имя Парамон или Парафей. Парамон (от греч. «стойкий, надёжный») в народной речи часто упрощалось: Парамон → Парам → Параф. Вариант Парафей — это народная форма того же имени, бытовавшая в крестьянской среде. Суффикс -ей со временем мог отпасть, а к основе Параф- добавили -есь. Вторая версия — связь с греческим именем Парфений (от «парфенос» — девственный), которое в устной речи превращалось в Парафён, Парафей, а затем в Парафесь. В пользу этой гипотезы говорит то, что имя Парфений было распространено среди духовенства, но фамилия Парафесь не выглядит семинарской — скорее, она родилась в крестьянской или казачьей среде, где имена переделывали до неузнаваемости.

География фамилии узкая. Парафесь встречается в основном в южных областях России (Краснодарский край, Ростовская область) и на востоке Украины. Это косвенно подтверждает украинскую модель образования: суффикс -есь типичен для Полтавщины, Черниговщины, Слобожанщины. Возможно, предки носителя фамилии были казаками или крестьянами, которых записывали по отцу — «Парафесь» значило «сын Парафея» или «сын Парамона». Исходное прозвище или имя-основа утрачено, но словообразовательная модель даёт чёткую подсказку: перед нами потомок человека, которого в быту звали Парафей или Парамон.