Фамилия Партышев образована от прозвища или имени Партыш, которое, в свою очередь, восходит к слову «партыш» — так в некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, называли маленького, низкорослого человека. Слово это родственно диалектному «парт» — «малорослый, коротышка». Таким образом, Партышев — это «сын Партыша», то есть потомок человека невысокого роста или имевшего соответствующее прозвище за свой облик.

Суффикс -ев указывает на типичную для русских фамилий модель притяжательного прилагательного: Партыш + ев = «чей?» — Партышев. В отличие от более распространённого -ов, суффикс -ев присоединялся к основам на мягкий согласный или шипящий (ш, ж, ч, щ). В данном случае основа оканчивается на -ш, поэтому и появляется -ев, а не -ов. Эта особенность делает фамилию морфологически прозрачной: она не переделывалась под общий стандарт, а сохранила исходную форму прозвища.

Встречается Партышев преимущественно в северных и центральных регионах России, что косвенно подтверждает диалектное происхождение корня. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с похожей фамилией — Партыш, Партышкин, — но именно форма Партышев встречается реже, что указывает на локальный характер её возникновения. В отличие, скажем, от фамилии Коротков, которая передаёт ту же идею «низкого роста», Партышев несёт в себе оттенок не просто длины, а скорее «коренастости» или даже «недорослости» — более конкретный образ из народной речи.

Есть и вторая, менее вероятная версия: что Партыш — это форма имени Парфён (от греческого Парфениос — «девственный», «чистый»). В народе имя Парфён часто сокращали до Парша, Паршутка, Партыш. Но в этом случае фамилия звучала бы как Парфёнов или Паршин, а суффикс -ышев встречается у уменьшительных форм крайне редко. Поэтому прозвищное объяснение — от слова «партыш» — выглядит убедительнее: оно прямое, без натяжек, и опирается на живую диалектную лексику.

Таким образом, предок современных Партышевых скорее всего был человеком невысокого роста, получившим меткое прозвище от односельчан. Фамилия не дворянская, не купеческая — она из крестьянской или посадской среды, где прозвища закреплялись за родом без переосмысления.