Фамилия Печугин образована от прозвища или нецерковного имени Печуга. Основа здесь — диалектное слово «печуга»: в вятских, пермских, вологодских говорах так называли печь, а в более широком смысле — теплое место у печи, запечье. Следовательно, прозвище мог получить либо печник (тот, кто кладет печи), либо человек, который постоянно сидел дома, у тепла, — домосед. В русской ономастике прозвища по занятию ремеслом встречаются часто, но интересно, что «печуга» — слово с уменьшительно-ласкательным оттенком, и здесь оно могло закрепиться за подмастерьем или младшим работником у печи.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Печугин — «сын Печуги», «из рода Печуги». Это типичная модель русских фамилий XVI–XVII веков, когда отчество или прозвище отца переходило к детям как наследственное имя. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от имен на согласный, -ин присоединялся к основам на -а или -я, что подтверждает бытовой, некалендарный характер исходного прозвища.

Встречаются и альтернативные версии. Некоторые исследователи связывают «Печугу» с тюркским корнем, где «печ» означает «господин» или «вождь», но эта гипотеза слабая: для русских фамилий Поволжья и центральной России гораздо вероятнее славянская основа, особенно с учетом географии бытования — фамилия Печугин чаще всего фиксируется в Кировской области (бывшая Вятская губерния) и Пермском крае, где как раз и было распространено слово «печуга» в значении «печь».

Стоит добавить, что у фамилии есть «двойники»: Печуров, Печников, Печкин. Все они образованы от разных форм одного корня, но Печугин стоит особняком из-за редкого суффикса -уг- в основе. Это говорит о том, что прозвище возникло не от книжного, а от живого диалектного слова, которое впоследствии вышло из активного употребления. В архивных записях XVII века встречаются крестьяне Печугины из Кайгородского уезда — это одно из ранних документальных подтверждений фамилии, и оно указывает на ее севернорусские корни.