Фамилия Педун — редкий случай, когда основа прозвища почти наверняка связана с диалектным глаголом, а не с именем или профессией. В русских говорах «педун» — это не просто слово, а ёмкая характеристика человека: так в некоторых областях называли того, кто много и надоедливо говорит, то есть болтуна или пустомелю. Глагол «педить» (или «педовать») в диалектах означал «говорить вздор, молоть чепуху», отсюда и прозвище Педун — «говорун», «пустозвон». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от отчества, суффикс -ун в русском языке активно создавал прозвища по действию или характерному признаку: бегун, крикун, ворчун. Педун стоит в том же ряду.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с глаголом «пестовать» (нянчить, воспитывать). В некоторых говорах «педун» могло быть искажённой формой слова «пестун» — так называли няньку или воспитателя. Однако эта гипотеза слабее: во-первых, замена «ст» на «д» в народной речи встречается, но редко, во-вторых, значение «болтун» для прозвища куда типичнее и психологически точнее — в крестьянской среде неодобрительно относились к пустословию, и такое прозвище легко прилипало к человеку.

По географии фамилия Педун — южнорусская, чаще всего встречается на Украине и в прилегающих областях России (Белгородская, Курская, Воронежская). Это подсказывает, что в основе могло лежать украинское слово «педун» в том же значении «болтун» или производное от «педа» (беда, несчастье) — тогда прозвище давали неудачливому человеку. Но и здесь главная версия остаётся диалектной и бытовой: предок носителя фамилии получил своё прозвище за длинный язык, а не за род занятий или имя.

Словообразовательная модель проста: корень «пед-» (от диалектного «педить»), суффикс -ун, нулевое окончание. Фамилия не склонялась по падежам как типичная русская на -ов, а оставалась в форме прозвища, что характерно для украинской ономастической традиции. В документах XIX века таких фамилий почти нет — они бытовали в устной речи и закрепились как фамилии только к концу столетия, в основном среди крестьян и казаков. Сведений о дворянских родах Педунов не обнаружено.

Искать однокоренные фамилии вроде Педенко, Педунов или Педюк имеет смысл — все они восходят к той же диалектной основе, но с разными суффиксами. Фамилия Педун — одна из тех, что хранит в себе не профессию и не отчество, а живую черту характера, которую когда-то подметили в предке соседи.