Фамилия Пекки — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычную модель русских фамилий, образованных суффиксами -ов, -ин или -ский. Её окончание на -и выдает в ней либо застывшую форму родительного падежа множественного числа (как в фамилиях Пекких, Пекки), либо, что вероятнее, иноязычное происхождение.

Самый прямой путь — финно-угорские языки. В карельском, финском, вепсском и ижорском языках слово «pekka» означает «Пётр» (от шведского «Peder»). Фамилия Пекки могла возникнуть как патроним (по отцу) в среде прибалтийско-финских народов, исторически живших на северо-западе России — в Карелии, на территории нынешней Ленинградской области, в Ингерманландии. В таком случае Пекки — это «сын Пекки» или просто «Пётр» в роли фамильного прозвища. Форма без суффикса типична для карельской и финской традиции: там фамилии часто представляют собой чистую основу имени.

Вторая версия, менее очевидная, — происхождение от прозвища «Пека» или «Пекарь». В русских говорах «пеком» или «пекой» иногда называли пекаря, хлебопёка. Но тогда фамилия должна была бы звучать как Пеков или Пекин. Форма Пекки могла появиться при записи на слух и последующем закреплении в документах, особенно если носитель жил в регионе с финским влиянием, где окончание -и воспринималось как нормальное.

Географически фамилия Пекки встречается в основном на северо-западе России, а также в Финляндии и среди ингерманландских финнов. В русских переписях и метрических книгах XIX века её фиксировали в Олонецкой, Петербургской и Новгородской губерниях. В советское время часть носителей переселилась в другие регионы, но концентрация остаётся в Карелии и Ленинградской области.

С точки зрения словообразования, фамилия Пекки стоит особняком: она не прошла через русскую морфологию, не получила типичного суффикса, а сохранила иноязычную основу. Это делает её хорошим маркером этнической или культурной принадлежности предков — скорее всего, они были карелами или финнами, принявшими православие, но сохранившими родовое имя в исходной форме.