Фамилия Пердебеков — редкая и не сразу прозрачная по смыслу. Чтобы её разобрать, нужно смотреть в сторону тюркских языков, где лежит основа «перде-». В татарском, башкирском, казахском языках «пәрдә» (перде) означает «занавес», «штора» или «завеса». В переносном смысле — «преграда», «покров». Вторая часть, «бек», — это титул, аналог «князя» или «господина» у тюркских народов. Таким образом, исходное прозвище или имя Пердебек можно перевести как «господин занавеса» или «князь-преграда». Звучит странно, но для тюркской ономастики это не редкость: составные имена часто описывали качества человека, его роль или внешнюю особенность. Возможно, предок носителя фамилии служил хранителем занавеса в ханском шатре или дворце — должность не шуточная, доступ к правителю через занавес контролировал именно такой человек. Либо прозвище дали за манеру держаться отстранённо, «за занавеской».

Русский суффикс -ов на конце указывает на способ образования: Пердебеков — это «сын Пердебека» или «из рода Пердебековых». Фамилия типична для крещёных татар или башкир, перешедших в православие и получивших фамилию по имени отца. Встречается она чаще всего в Оренбургской области, Башкортостане, Татарстане. Ударение, скорее всего, падает на последний слог: ПердебекОв.

Есть и альтернативная версия, менее вероятная. В некоторых тюркских диалектах «перде» может означать «портьера» как элемент интерьера, и тогда прозвище мог получить ткач или торговец тканями. Но титул «бек» в таком бытовом прозвище выглядит натяжкой. Версия с придворной должностью или статусным именем убедительнее. В любом случае, фамилия не крестьянская и не дворянская в русском понимании — она из тюркской служилой среды, где титулы и прозвища смешивались свободно.