Фамилия Перекангуев — редкая, с неочевидной на первый взгляд основой. Её ядро, вероятнее всего, тюркское или монгольское, что неудивительно для южнорусских, сибирских или кавказских регионов. Разложим по частям: корень «перекан-» или «переканг-» и типичный русский фамильный суффикс «-уев».

Самый правдоподобный вариант — происхождение от тюркского личного имени или прозвища Перекан. В тюркских языках «перек» (или «берек») может означать «крепкий», «сильный», а также «дар» или «благословение». В сочетании с суффиксом «-ан» (уменьшительно-ласкательным или образующим имя) получается Перекан — «крепкий», «силач» или «дарованный». Суффикс «-гуев» в русских фамилиях встречается реже, чем «-ов» или «-ин», но он характерен для фамилий, образованных от тюркских основ с конечным «-гу» или «-ку». В данном случае «Перекангуев» могло возникнуть из формы Перекангу (основа + аффикс принадлежности) с добавлением русского «-ев». То есть буквально: «сын Перекангу» или «из рода Перекангу».

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с географическим названием. В Забайкалье или Бурятии мог существовать топоним Перекангуй (речка, урочище). Тогда фамилия указывала бы на выходца из этих мест: «Перекангуев» — «тот, кто с Перекангуя». Редкость фамилии говорит о том, что её носители — потомки, скорее всего, одной семейной ветви, возможно, казаков или крестьян из приграничных районов, где смешивались русские, тюркские и монгольские элементы. В любом случае, основа фамилии — прозвище или имя, связанное с силой, крепостью или даром, а суффикс «-уев» выдаёт её восточное происхождение, адаптированное русской грамматикой.