Фамилия Перепека — яркий пример того, как прозвище, данное за кулинарную сноровку или особенность, закрепилось в качестве родового имени. В основе лежит глагол «перепекать» — печь заново, слишком долго или, наоборот, подсушивать до хруста. Скорее всего, так в старину называли человека, который занимался выпечкой хлеба или пирогов, причем делал это с каким-то особым приёмом: мог перепекать хлеб до румяной корки или, наоборот, славился тем, что постоянно передерживал его в печи. Прозвище могло быть и ироничным — для неумелого пекаря, чей хлеб вечно выходил пересушенным.

Модель образования проста и архаична: основа глагола в повелительном наклонении или чистая основа без суффикса. Такое бессуффиксное прозвище (Перепека) — типично для восточнославянской ономастики XVI–XVII веков, когда человека могли назвать по действию, не добавляя фамильных окончаний. Позже, при переходе в фамилию, форма застыла без изменений. В отличие от более распространенных фамилий на -ов (Перепёлкин, Перепечин), Перепека сохранила исходный глагольный облик, что делает её более редкой и древней по структуре.

Интересно, что фамилия могла возникнуть не только в среде профессиональных пекарей. В диалектах «перепекой» называли и сухую, жаркую погоду, которая «перепекает» землю, и даже крепко зажаренное мясо. Поэтому прозвище могло достаться человеку с горячим, «жгучим» нравом или, напротив, чрезвычайно сухому и худощавому. Географически фамилия встречается в основном в центральных и южнорусских областях, а также на Украине, где глагол «перепікати» также широко употребителен.

Сравните с однокоренными фамилиями: Перепечин (от «перепечина» — то, что перепечено), Перепёлкин (от птицы). Перепека стоит особняком — она не указывает на предмет или животное, а прямо называет действие, что встречается реже. Это даёт основание предполагать, что предок носителя фамилии был либо заметным мастером печного дела, либо получил прозвище за какую-то яркую бытовую черту, связанную с едой или характером.