Фамилия Перета — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В отличие от большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин, она застыла в краткой форме, что сразу указывает на нерусскую или позднюю модель образования. Скорее всего, перед нами фамилия украинского, белорусского или польского корня, где такие усечённые формы встречаются чаще.

Самая вероятная версия связывает фамилию с глаголом «переть» (устаревшее «перетать» — давить, налегать, или диалектное «переть» — идти с трудом, нести что-то тяжёлое). В таком случае Перета — прозвище упрямого, настойчивого человека, который «прёт напролом», либо того, кто занимался тяжёлой физической работой, например, бурлака или грузчика. В говорах «перета» могло означать и нечто вроде «напор», «сила», что тоже укладывается в эту логику.

Менее распространённая, но возможная версия — от украинского или польского слова «перет» (палец), через диалектное «перета» — что-то, связанное с пальцами, например, прозвище мастера, работающего руками. Однако эта гипотеза слабее, так как в славянской антропонимии прозвища от частей тела обычно образуются через суффиксы (Пальцев, Перстов), а не через чистую основу.

Суффикс -а в фамилии Перета характерен для западно- и южнорусских земель, а также для украинской и белорусской ономастики. Встречаются однокоренные фамилии Перетин, Перетов, Перетко, но Перета стоит особняком. Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Гомельской областям и западу России, что подтверждает её западное происхождение.

Исторически фамилия могла возникнуть как прозвище в казацкой или крестьянской среде, где ценились физическая сила и упорство. В официальных документах Российской империи она встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Носители фамилии Перета, скорее всего, не принадлежали к дворянству, а были простыми людьми, чьё прозвище закрепилось за потомками без изменений.