Фамилия Перун — редкий случай, когда народная этимология напрашивается сама собой, но лингвистика предлагает более приземлённый и убедительный путь. Самое очевидное объяснение — связь с громовержцем, верховным божеством славянского пантеона. Перуна представляли высоким, плечистым, черноволосым, с золотой бородой; он ездил по небу в колеснице и пускал огненные стрелы. Если следовать этой версии, прозвище Перун мог получить человек с крутым нравом, вспыльчивый или физически мощный, — такое имя-оберег или уличное прозвище закрепилось бы за ним в память о буйном характере. Однако у этой гипотезы слабое место: имена языческих богов в народной среде после крещения Руси почти не использовались как личные прозвища, слишком силён был запрет.

Правдоподобнее выглядит версия, которая выводит прозвище из глагола «переть». В диалектах он означал «давить, жать, налегать», а также «лезть силой, напролом». Тогда Перуном называли человека настойчивого, даже наглого, который не считался с препятствиями и шёл к цели, расталкивая всех локтями. В этом же ряду стоит выражение «переть душой» — то есть лукавить, кривить душой. Отсюда второе значение прозвища: хитрец, не всегда правдивый человек, умелый притворщик. Оба смысла прекрасно ложатся в модель народных прозвищ, которые часто строились на иронии и подмечали не внешность, а поведение.

Сама фамилия образована без суффикса, напрямую от прозвища, — такой тип характерен для украинских, белорусских и южнорусских фамилий. В северных и восточных русских землях чаще добавили бы -ов или -ин, получив Перунов или Перунин, но форма Перун закрепилась как самостоятельная. Это же слово входило в состав сложных прозвищ: например, однокоренные фамилии Перепелов, Перепёлкин к Перуну отношения не имеют, а вот Перепелов и Перунов — уже другая история, там основа иная.

Интересно, что фамилия Перун встречается и у поляков, и у чехов, что подтверждает её общеславянский характер. В польском языке «piorun» — это «молния», и там фамилия звучит как Piorun. Это косвенно поддерживает мифологическую версию: в народной памяти имя бога грома слилось с самим явлением молнии, и прозвище могло означать «быстрый, как молния», «стремительный». Но для русского языка более органичным остаётся бытовое значение — от «переть», то есть напористый, упрямый, пробивной человек.

Точных сведений о том, когда именно появилась фамилия Перун, нет. В переписных книгах и ревизских сказках она встречается спорадически, в основном на Украине и в южных уездах России. Известных носителей с громкой исторической биографией среди Перунов нет, что неудивительно: фамилия редкая, локальная. Но именно эта редкость делает её ценной для потомков — она почти не изменилась за столетия и сохранила прямую связь с прозвищем предка, каким бы оно ни было: насмешливым, уважительным или просто констатирующим характер.