Фамилия Перунина — яркий пример того, как русская фамилия может звучать почти как миф, но иметь при этом вполне земное происхождение. Вопреки первому впечатлению, её основа — не имя славянского бога грома, а древнерусское нецерковное имя Перун.

В языческой Руси имя Перун давали мальчикам, желая им силы, грозности и удали. Оно было распространено задолго до крещения и встречается в берестяных грамотах. От этого имени через притяжательное прилагательное («чей?» — «Перунин») и родилась фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Перунин сын, то есть потомок Перуна. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я (как Путя — Путятин, Шуя — Шуин).

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Перуня. Так могли назвать человека с громким голосом, тяжёлой походкой или вспыльчивым характером — то есть того, кто «гремит» и «мечет молнии». В этом случае фамилия отражала бы не имя предка, а его поведение или внешность.

Географически фамилия Перунина редка и встречается точечно, чаще в северных и центральных областях России, где дольше сохранялись дохристианские имена. Встречается она и на Урале, куда переселенцы приносили свои родовые прозвания. Женская форма Перунина — это не вариант фамилии, а исходная форма от мужского Перунин, которая в русской традиции закрепилась за женщинами (дочь или жена Перунина).

Таким образом, носители фамилии Перунина — потомки человека по прозвищу или имени Перун. Никакой связи с божеством, кроме лингвистической, здесь нет, но само звучание фамилии невольно отсылает к древнейшим пластам русской истории.