Фамилия Пидатко — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не скрывается за суффиксом. Основа здесь — «пидаток», и это не что иное, как искажённое украинское или южнорусское «пятачок» (поросёнок, а также монета в пять копеек). Суффикс -к- в украинских фамилиях часто выполняет уменьшительную или прозвищную функцию, а конечное -о указывает на украинское происхождение (ср. Дудко, Шевченко). Таким образом, Пидатко — это «пятачок», то есть человек, которого в шутку называли поросёнком или, что вероятнее, мелкой монетой, то есть невысоким, щуплым или небогатым.

Модель образования прозрачна: диалектное «пидаток» (с «и» вместо «я» — явление, характерное для ряда говоров) плюс суффикс -к- и окончание -о. Фамилия чисто украинская по морфологии, но могла возникнуть и на юге России, в зоне смешения языков. Редкость фамилии (она не входит в распространённые списки) говорит о том, что прозвище было локальным, возможно, в одной семье.

Есть и другая версия, менее правдоподобная: от слова «пид» (укр. «под») и «атка» (устар. «утка») — то есть «подутка», прозвище по месту жительства. Но фонетически «пидаток» уверенно выводится из «пятачок», а не из сложного составного слова. В пользу первой версии говорит и то, что в украинских фамилиях много «животных» прозвищ (Бичок, Козел, Півень), а денежные прозвища (Грош, Копійка) тоже встречаются.

Носитель фамилии — скорее всего, потомок человека, которого дразнили за рост, комплекцию или скупость (если речь о монете). Сословно фамилия не указывает на дворянство: такие прозвища давали крестьянам и казакам. В современных документах фамилия встречается единично, в основном на Украине и в приграничных областях России, что подтверждает её региональную природу.