Фамилия Пидустов образована от прозвища Пидуст, которое, в свою очередь, восходит к украинскому названию мелкой речной рыбы семейства карповых — пидуста. Эта рыба, известная также как подуст, водится в реках с быстрым течением и чистой водой. Такое прозвище, скорее всего, относилось к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий: родоначальник Пидустовых, вероятнее всего, был рыбаком или жил в месте, где ловля этой рыбы была основным промыслом.

Словообразовательная модель фамилии стандартна для восточнославянской традиции: суффикс -ов присоединялся к основе прозвища, образуя притяжательное прилагательное, которое затем закрепилось как фамилия. Потомок человека, которого в округе знали как Пидуста, получал именование «Пидустов сын», которое со временем сократилось до фамилии Пидустов.

Здесь стоит обратить внимание на географический след. Украинское происхождение прозвища указывает на южные или юго-западные регионы Российской империи, где украинский язык был распространён, — это территории современной Украины, а также Курская, Воронежская, Белгородская губернии. Оттуда фамилия могла распространиться по всей России вместе с переселенцами.

В русской ономастике фамилия Пидустов стоит в ряду «рыбных» фамилий, таких как Карасёв, Окунев, Ершов или Лещёв. Но в отличие от них, она образована не от общеупотребительного русского названия, а от диалектного украинского. Это делает её более редкой и локально привязанной. В словарях фамилий, например в работах Б. Унбегауна, подобные прозвищные фамилии от названий рыб описываются как типичные для крестьянской среды, где промысел часто определял человека сильнее, чем его личное имя.

Версия о связи с рыбой — основная и наиболее правдоподобная. Альтернативные гипотезы, например о связи с каким-либо личным именем, не находят подтверждения: в доступных источниках такое имя или прозвище не фиксируется. Поэтому можно уверенно говорить, что фамилия Пидустов — это память о предке-рыбаке, чей промысел был настолько важен, что заменил ему имя в глазах соседей.