Фамилия Пинежанинов — один из тех редких случаев, когда географическое происхождение читается почти безошибочно. Основа здесь — «Пинежанин», то есть житель берегов реки Пинеги. Пинега — крупный приток Северной Двины в Архангельской области, и весь этот край исторически называли Пинежьем. Человек, переселившийся оттуда в другую местность, получал прозвище Пинежанин — «выходец с Пинеги». А фамилию образовали уже от этого прозвища с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ов: «чей?» — Пинежанинов, то есть сын или потомок Пинежанина.

Интересна словообразовательная цепочка. В русских фамилиях от названий жителей (катойконимов) редко встречается двойной суффикс. Обычно говорят: Москвич → Москвичёв, Тверич → Тверитинов. Здесь же к основе «Пинежанин» добавили -ов, что дало нестандартную, громоздкую, но абсолютно прозрачную по смыслу форму. Такая модель характерна для Севера и Поморья, где фамилии часто складывались позже, чем в центральной России, и могли сохранять архаичные или диалектные черты.

По сословной принадлежности предки Пинежаниновых, скорее всего, были государственными (черносошными) крестьянами или посадскими людьми. Дворян на Пинеге практически не было, а основным занятием местных жителей служили рыболовство, охота, солеварение и лесной промысел. Фамилия не получила широкого распространения за пределами Архангельской области и встречается преимущественно на севере европейской части России, что подтверждает её локальный характер.

Корень «Пинеж-» восходит к финно-угорскому субстрату: название реки Пинега, по наиболее принятой версии, происходит из прибалтийско-финских языков и означает «малая» или «извилистая». Так что в фамилии Пинежанинов сплелись сразу два пласта: древний, дославянский гидроним, и поздняя, чисто русская модель фамильного образования.