Фамилия Пинижанинов — одна из тех, чья основа скрыта за неочевидным корнем и требует лингвистической реконструкции. Сразу скажем: перед нами не крестильное имя и не географическое название, а прозвище, связанное с диалектным словом. Разобрать её помогает суффикс -инов, который указывает на принадлежность («чей?»). В русских фамилиях этот суффикс часто присоединяли к основам, оканчивающимся на -ин: Пинижанин → Пинижанинов. То есть исходная форма — Пинижанин, а значит, предка звали Пинижаня.

Корень здесь — «пиниж-». В русских говорах, особенно северных и вологодских, «пинижать» означало «плакать, хныкать, ныть». Соответственно, Пинижаня — прозвище плаксивого, капризного или обидчивого человека. В ономастических работах, например у Б. Унбегауна, такой тип прозвищ по поведенческим чертам — обычное дело: Чудин, Плакса, Крикун. Прозвище давали не обязательно в укор, иногда — как семейное прозвание, которое закрепилось за детьми.

Модель образования проста: от глагольной основы «пинижать» через суффикс -ан(я) (сравните: гудеть — гудяня, ворчать — ворчаня) получили личное прозвище Пинижаня, а затем — отчество-фамилию Пинижанинов. Суффикс -ан(я) в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, что делает фамилию заметной на общем фоне. Фонетически форма устойчива: ударение, скорее всего, падает на третий слог — Пинижа́нинов.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном в центральных и северных областях России, но массовой статистики нет. В дореволюционных переписях она не фиксировалась широко, что говорит о локальном бытовании — возможно, в среде крестьян или однодворцев. Сословная принадлежность предков — почти наверняка крестьянство, так как фамилии на -инов от прозвищ редко встречались у дворянства.

Альтернативная версия связывает корень с тюркским или финно-угорским влиянием, но она слаба: в языках соседних народов нет очевидных параллелей, а глагол «пинижать» хорошо документирован в русских диалектных словарях. Поэтому версия с плаксивым прозвищем — основная и правдоподобная.

Итог: фамилия Пинижанинов образована от прозвища Пинижаня (плакса, нытик) с помощью типичной русской патронимической модели. Предки — скорее всего, крестьяне из северных или центральных губерний, а сама фамилия — редкий образец диалектного словообразования, сохранившийся до наших дней.