Фамилия Пинижанина — женская форма фамилии Пинижанин, и её разбор стоит начать с суффикса, который многое говорит о происхождении. Окончание -а указывает, что перед нами вариант для женщины (в современном русском быту она могла остаться неизменяемой, если замужняя, или быть полученной от отца). А вот суффикс -ин- в основе мужской формы — один из самых распространённых в русских фамилиях, он отвечает на вопрос «чей?»: сын или потомок Пинижанина. Но сама основа «Пинижан» — редкая и требует отдельного внимания.

Скорее всего, фамилия образована от прозвища или имени, связанного с географическим названием. В русской ономастике часто встречаются фамилии, указывающие на выходца из определённой местности: Пинижанин мог быть человеком, родом из села или деревни с корнем «Пиниж-». Например, на карте России существуют населённые пункты с похожими названиями: Пинигино, Пинега, Пинязь. Суффикс -анин (или -янин) в русском языке как раз обозначает жителя или уроженца: «рижанин» — из Риги, «киевлянин» — из Киева. Соответственно, «Пинижанин» — это «житель Пиниж» (предположительно, какой-то местности с таким названием). Ударение в фамилии, вероятно, падает на второй слог: Пинижа́нина.

Есть и другая, менее вероятная версия: основа могла произойти от личного имени или прозвища. В старину бытовали имена-обереги или имена по внешним признакам, но убедительных параллелей в известных словарях (например, у Веселовского или Никонова) для слова «Пинижа» не зафиксировано. Поэтому версия с географическим происхождением выглядит правдоподобнее: фамилия могла закрепиться за крестьянами или посадскими людьми, переселившимися из одного региона в другой, и указывала на их «малую родину». Сословной принадлежности без дополнительных данных не установить — фамилия встречается и у крестьян, и у мещан, но в любом случае она отражает конкретное место или прозвище, а не профессию.

Написание фамилии — с двумя «н» (Пинижанина), что характерно для суффикса -анин-: «Пиниж-анин-а». Встречаются варианты с одной «н» (Пинижанина), но это, скорее всего, результат упрощения на письме или ошибки паспортистов. В целом фамилия редкая, её носители могут встречаться в центральных и северных областях России, где сохранилась традиция называть людей по месту выхода.