Фамилия Пискуновская — женская форма мужской фамилии Пискуновский, а та, в свою очередь, образована по типичной для восточнославянских земель модели от прозвища или мирского имени Пискун. Основа здесь — глагол «пискать» или «пищать». В старину Пискуном могли назвать человека с тонким, высоким голосом, плаксивого ребенка или того, кто постоянно жаловался (пищал). Реже — мастера, игравшего на дудке, свирели или другом духовом инструменте, который в народе называли «пискулькой».

Суффикс -ск- в основе Пискуновский указывает на географическое или дворянское происхождение. Чаще всего такие фамилии на -ский/-цкий получали жители шляхетских земель Речи Посполитой (современные Беларусь, Украина, восток Польши). Владелец поместья Пискуново или выходец из села с таким названием становился Пискуновским. В России же фамилии на -ский нередко давали семинаристам при поступлении в духовные училища — им могли «облагородить» простонародное прозвище Пискун.

Важный нюанс: окончание -ая в женском варианте — чисто русская грамматическая норма для прилагательных. В украинском или белорусском варианте фамилия звучала бы как Пискуновська. Так что носительница фамилии Пискуновская с высокой вероятностью имеет корни в западнорусских землях, где топонимы с основой «Пискун-» встречаются до сих пор, например, деревня Пискуны в Витебской области.

Интересно, что в отличие от более частых фамилий Пискунов (всего 1–2 тысячи человек) или Пискуновых, вариант Пискуновская — редкий. Он не попал в массовые списки советской паспортизации, а потому мог сохраниться именно в той местности, где когда-то было небольшое имение или хутор, названный по прозвищу его основателя.