Фамилия Пискун образована от прозвища Пискун, в основе которого лежит глагол "пищать". Однако прозвище Пискун могло закрепиться и за взрослым человеком, обладающим высоким голосом. Скорее всего, такое прозвище указывало на определенные особенности голоса предка, либо на его характер.