Фамилия Плахтюрин — редкая и морфологически прозрачная, но её корень не сразу бросается в глаза. Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель образования от основы, оканчивающейся на согласный или, в данном случае, на -я. Сама основа — Плахтюр- — скорее всего, является производной от прозвища или имени Плахтя (или Плахтюра), которое, в свою очередь, восходит к диалектному слову плахта.

В русских говорах (особенно южных и западных) плахта — это не только отрез ткани, но и конкретный предмет одежды: широкая юбка, передник, а иногда и грубая холстина. В украинском и белорусском языках это слово закрепилось за женской поясной одеждой — куском плотной шерстяной или бумажной ткани, который носили вместо юбки. Таким образом, прозвище Плахтя мог получить человек, носивший такую одежду (возможно, из-за бедности или привычки), либо тот, кто её изготавливал или торговал ею. Учитывая, что прозвища от названий одежды часто давались по характерной детали внешнего вида, первая версия выглядит правдоподобнее.

Фамилия Плахтюрин — явно недворянская, а крестьянская или мещанская, и её география подтверждает это. Основные очаги бытования — южнорусские области (Курская, Белгородская, Воронежская) и приграничные районы Украины. Это объясняет и «южный» вид корня: окончание -юрин (а не, скажем, -урин или -орин) характерно для фамилий, образованных от имён и прозвищ с исходом на мягкий согласный или -я (сравните: Плахтя → Плахтюрин, как и Костя → Костюрин, Федя → Федюрин).

Есть и менее очевидная версия: связь с немецкой или еврейской фамилией Плахт (от нем. Pflacht — «долг, повинность», или от идишского פּלאַכט — «плот»). В таком случае русский суффикс -юрин мог быть добавлен при адаптации переселенцев, но это маловероятно: фамилия слишком плотно привязана к русскому диалектному слову и характерной для этих мест модели словообразования. Скорее всего, перед нами чисто восточнославянская фамилия, возникшая в среде крестьян или ремесленников, где прозвище по одежде было понятным и естественным.