Фамилия Плахушкина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Плахушкин. Это типичная «фамилия-прозвище», образованная по модели, характерной для русского Севера и ряда центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Основа — прозвище Плакуша или Плахушка. Здесь мы сталкиваемся с любопытным моментом: корень «плах-» может вести к двум разным смыслам.

Первый и самый очевидный вариант — связь с глаголом «плакать». Прозвище Плакса, Плакуша давали человеку плаксивому, обидчивому, либо, наоборот, тому, кто профессионально оплакивал покойников (в похоронных обрядах). В северных говорах «плакуша» — это ещё и плакучая ива, но вряд ли прозвище давали по дереву.

Второй вариант, менее заметный, но более редкий и интересный, — от слова «плаха» (полено, чурбан, а также орудие казни). В диалектах «плахушка» — это небольшая плаха, дощечка. Тогда прозвище могло относиться к плотнику, дровосеку или, в переносном смысле, к человеку грубому, «дубовому». Однако для фамилии Плахушкин эта версия слабее: суффикс -ушк- в русских прозвищах чаще уменьшительно-ласкательный (от «плакса»), чем предметный.

Сам суффикс -ушк- в основе — характерная деталь: такие прозвища (Плакушка, Говорушка, Вертушка) были распространены в крестьянской среде. Фамилия Плахушкина, скорее всего, возникла не в дворянской, а в простонародной среде, и её носительницей могла быть женщина, чей муж или отец получил прозвище за слезливость или профессию плакальщика. В современных справочниках фамилия встречается нечасто, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в Поволжье или на Русском Севере, где такие модели словообразования сохранялись дольше.