Фамилия Подпругина начинается не с имени, а с прозвища, связанного с конской упряжью. Основа — «подпруга», то есть широкий ремень, который стягивает седло или седелку на лошади. Человек мог получить прозвище Подпруга по двум причинам: либо он был шорником — мастером, который шил и чинил конскую сбрую, либо внешность или походка напоминали тугой ремень (например, сухощавый, подтянутый человек). Вторая версия менее вероятна, но полностью исключать её нельзя: прозвища от предметов упряжи давали и по характеру («тугой», «упрямый»).

Модель образования простая и типичная для русских фамилий: к основе «Подпруг-» добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Подпругин буквально означает «сын Подпруги» или «из семьи Подпруги». Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов женского рода (подпруга — она), и в этом смысле фамилия Подпругин стоит в одном ряду с такими, как Кожин (от «кожа») или Дугин (от «дуга»).

С географической точки зрения фамилия редкая и не имеет ярко выраженного ареала. Встречается разрозненно, но чаще — в центральных и южных регионах России, где коневодство и сельское хозяйство были развиты исторически. В старых переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и ремесленников с прозвищем Подпруга, особенно в районах, где держали лошадей для пахоты и перевозок.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавает. Встречается как ПодпрУгин (с ударением на второй слог, по аналогии с «подпрУга»), так и ПодпругИн (на последний слог, по модели многих фамилий на -ин). Первый вариант, вероятно, более старый и прямо отражает исходное слово.

Сословная принадлежность предков — почти наверняка крестьянская или ремесленная. Шорники и конюхи не относились к высшим сословиям, поэтому дворянских ветвей у Подпругиных, скорее всего, нет. Фамилия не фиксируется в родословных книгах, что подтверждает её «низовое» происхождение от прозвища по профессии.