Фамилия Подыниногина — редкий и выразительный пример того, как прозвище, данное человеку несколько веков назад, дошло до наших дней в виде фамилии. Она образована от прозвища Подынинога, которое, в свою очередь, представляет собой ироничное именование, построенное по принципу «глагол в повелительном наклонении + существительное». В украинской и южнорусской традиции таких прозвищ было множество: Копайгора, Вырвиглаз, Варивода, Непийвода, Непийпиво. Все они звучали как короткая насмешливая команда, закреплявшая за человеком какую-то заметную особенность.

Прозвище Подынинога буквально означает «подними ногу». Скорее всего, так дразнили человека, который медленно ходил, неловко ступал или не слишком уверенно держался в седле, — всадника, которому приходилось постоянно приподнимать ногу, чтобы не зацепить стремя или препятствие. Не исключено, что прозвище закрепилось за кем-то, кто часто спотыкался на ровном месте: окружающие могли иронично советовать ему «подыни ногу», и эта фраза превратилась в постоянное именование.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Подыниногин — это «сын Подыниноги», потомок человека с таким прозвищем. Модель образования типична для русских фамилий, но основа здесь необычная: если большинство фамилий восходит к именам, профессиям или чертам характера, то эта — к целой бытовой фразе, брошенной в насмешку. Именно этим она и ценна: за ней стоит не абстрактное понятие, а живая сценка из повседневной жизни предков.

Встречается фамилия преимущественно в регионах, где исторически смешивались русские и украинские говоры, — на юге России, в Поволжье и в бывших казачьих областях. Там подобные «глагольные» прозвища приживались особенно легко. При этом стоит отметить, что фамилия не получила широкого распространения: она осталась редкой, что делает её ещё более интересной для семейной истории. Потомок человека, которого когда-то иронично окликнули «Подынинога», со временем получил фамилию, хранящую память об этом прозвище как о самом употребительном именовании предка.